Am 12. Dezember 1990 wurde durch eine Gruppe von Sportschützen, Schießsportinteressenten und Mitgliedern der ehemaligen Schützengilde der Stadt Löbejün die Schützengilde Löbejün 1699 e.V. neu konstituiert. Zum 1. Vorsitzenden wurde 1990 der Schützenbruder Holm Harzer gewählt.

Von 1991 bis 1994 übte der Schützenbruder Günter Krikcziokat die Funktion des 1. Vorsitzenden der Schützengilde aus. Im Jahre 1994 wurde Schützenbruder Hans-Joachim Georges zum 1. Vorsitzenden gewählt. Er war in dieser Funktion bis zum Januar 2000 tätig und machte während dieser Zeit die ersten Vorarbeiten zum Bau der Schützenanlage. Seit Februar 2000 steht der Schützengilde Löbejün als 1. Präsident der Schützenbruder Reinhard Jäckel vor. Mit ihm begannen die offiziellen amtlichen Bauarbeiten der neuen Schützenanlage in Löbejün . Dank der fleißigen Arbeit der Mitglieder der Schützengilde wurde unter seiner Führung ein neuer Schützenstand mit einer 50m und 100m Anlage sowie ein neues Vereinshaus errichtet. Besonderen Dank gilt aber auch der großzügigen Unterstützung durch die Stadt Löbejün mit seinem Stadtrat und dem Bürgermeister Thomas Madl sowie dem Landessportbund Sachsen-Anhalt und vielen anderen Sponsoren. Ab dem Jahr 2010 entstanden auf dem Gelände der Schützengilde ein 6 bahniger Pistolenstand mit moderner elektronischer Schwenkscheibenanlage und eine moderne 6 bahnige Luftpistolen/-gewehranlage. Diese ist ausgerüstet mit einer elektronischen Mayton-Trefferanzeige. Sie wurde zu 90% mit Mitteln der EU gefördert. Im Jahr 2016 enstand ebenfalls auf dem Gelände der Schützengilde eine Übungsanlage für Bogenschützen.
Schwerpunkt der Arbeit in der Schützengilde Löbejün ist das sportliche Schießen entsprechend dem Richtlinien des Deutschen Schützenbundes und die Pflege der Schützentradition der Schützengilde Löbejün 1699 e.V.. Die Schützengilde Löbejün 1699 e.V. ist mit ihren 110 Mitgliedern der zweitgrößte Schützenverein im Saalekreis. Seit dem Jahr 2000 ist die Schützengilde auch auf sportlichem Gebiet einer der erfolgreichsten Vereine im Saalekreis. Davon zeugen die vielen Kreis- und Landesmeister sowie Kreis- und Landesrekorde.Ein weiteres Zeugnis der Leistungsfähigkeit sind die vielen Qualifikationen zu den Deutschen Meisterschaften. Die Schützengilde hat mehrere Sportgruppen für die einzelnen Disziplinen sowie eine Frauen- und Jugendgruppe. Hervorzuheben ist aber auch die Traditionsarbeit. Schwerpunkt ist hier die Aufarbeitung der Geschichte der Schützengilde Löbejün. Des weiterem pflegt man die historisch einmalige überlieferte Uniform, das Salutschießen zu Höhepunkten in der Stadt Löbejün und der Region und das Böllern der Kanonenbatterie. Die Schützengilde Löbejün 1699. e.V. feierte 1999 ihr 300 jähriges Bestehen.
Die Schützengilde Löbejün 1699 e.V. ist Mitglied des Deutschen Schützenbundes und Gründungsmitglied des Landesschützenverbandes Sachsen- Anhalt.